Die TI BBD stellt sich vor

Die Vision der translationalen Infrastruktur "Bioressourcen, Biodaten und digitale Gesundheit (TI BBD)" ist es, eine übergreifende Standardisierung von biomedizinischen Daten und Interoperabilität von Datenbanksystemen sowie einen verbesserten Zugang zu relevanten Bioproben, Biodaten, digitalen Werkzeugen und Methoden innerhalb des DZIF zu ermöglichen. 

Wir, die Mitglieder der TI BBD, möchten Ihnen einen Einblick in unsere Services im Allgemeinen geben und Sie über verschiedene Themen des Datenmanagements detailliert informieren: am 2. Mai 2023 von 9-11 Uhr im Rahmen eines Online-Workshops.

9-10 Uhr: Präsentation der TI BBD-Dienstleistungen wie der neuen DZIF IT-Plattform inklusive des Data & Tools-Hubs und des DZIF-Intranets sowie den Unterstützungsmöglichkeiten bei der Stellung von FlexFunds-Anträgen mit anschließender Q&A-Session.

10-11 Uhr: Workshop im World-Café-Format zum Thema Datenmanagement. Nach einer gemeinsamen einführenden Präsentation finden Breakout-Sessions zu folgenden wählbaren Themen statt:

DZIF Kerndatensatz / Metadaten Repository (MDR)

Ein Kerndatensatz ist ein Satz strukturierter, vordefinierter Datenelemente zur Beschreibung bestimmter Gegenstände oder Verfahren, z. B. Biomaterialien, Erreger, verschiedene Studientypen etc. Das TI BBD etabliert einen DZIF-Kerndatensatz, der speziell auf die Anforderungen in der Infektionsforschung zugeschnitten ist, um die Datenerfassung zu standardisieren und damit die Harmonisierung über DZIF-Studien hinweg zu unterstützen. Zusätzlich wird ein Mapping auf internationale Terminologie und Standards vorgenommen. Die Metadaten, die die jeweiligen Datenelemente und ihre Zusammenhänge beschreiben, werden im neuen DZIF-Metadaten-Repository spezifiziert und katalogisiert, das hier vorgestellt wird.

DZIF Zentrales Bioprobenregister (DZIF-ZBR)

Bioproben und die dazugehörigen medizinischen Daten sind für die translationale Forschung im DZIF von hohem Wert. Das TI BBD ist verantwortlich für das DZIF-Zentralregister für Bioproben (DZIF-ZBR), um die Sichtbarkeit von Bioproben, die für bestimmte Forschungsinhalte zur Verfügung stehen, über die dezentralen DZIF-Lagerstandorte hinweg zu verbessern. Das DZIF-ZBR führt als eine Art Katalog die Bioprobendaten aus verschiedenen DZIF-Studien und Partnerstandorten zusammen und ist damit ein wertvolles Instrument zur Datenharmonisierung. Durch individuelle Suchabfragen ist er ein effektives Projektplanungsinstrument für analytische Studien mit Bioprobenbeteiligung.

Pathogendaten und Datenbanken

Die TI BBD bietet drei verschiedene Datenbanken für die Integration von pathogenbezogenen Daten und Metadaten an. Rohdaten, Assemblies und Metadaten können an die OMICs-Datenbank "Bacterial assemblies & Metagenomics" übermittelt werden. Die OMICs-Datenbank wird in Zukunft auch die Integration von Massenspektrometriedaten ermöglichen. Die EnteroBase-Datenbank wurde kürzlich für Genomsequenzen von Mycobacterium tuberculosis eingerichtet und wird in Zukunft um ESKAPE-Bakterien und andere DZIF-relevante Krankheitserreger erweitert werden. BacDive ist die weltweit größte Datenbank für standardisierte bakterielle Informationen und wird derzeit um phänotypische Vorhersagen wie AMR erweitert.

Epidemiologische Daten

Das TI BBD hilft DZIF-Forschenden bei der Generierung und Analyse epidemiologischer Daten, indem es sie bei der Evidenzsynthese (z.B. systematische Übersichten und Meta-Analysen), bei dynamischen Modellierungsanalysen und beim Design und der Analyse epidemiologischer Studien unterstützt. Außerdem bietet es über "serohub.net", einer Plattform für Seroprävalenzstudien zu SARS-CoV-2, Repositorien für Studiendaten einzelner Teilnehmer.

Ethik und informierte Einwilligung

Jedes Studiendesign muss ethische Aspekte und einen verantwortungsvollen Umgang mit Daten berücksichtigen, die während der gesamten Studiendauer und darüber hinaus gelten. Die TI BBD unterstützt DZIF-Forschende bei der Navigation durch ethische Anforderungen und Dokumentationen und berät bei der (Wieder-)Verwendbarkeit und Weitergabe von Bioproben und Daten, indem es z.B. entsprechende Mustervorlagen bereitstellt. 

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Die Veranstaltung ist kostenfrei. Bitte registrieren Sie sich über das unten stehende Formular, um uns bei der Organisation der Veranstaltung zu unterstützen.

Wir freuen uns, Sie am 2. Mai 2023 begrüßen zu dürfen!